El Programa de Posgrado en Ciencia e Ingeniería de la Computación ofrece tres planes: maestría, doctorado y especialización, donde se articulan seis campos de conocimiento en los niveles de maestría y doctorado: Teoría de la computación; Ingeniería de Software y bases de datos; Inteligencia Artificial; Redes y seguridad en cómputo; Señales, imágenes y ambientes virtuales y Computación científica, tres de los cuales se vinculan también con el plan de estudios de especialización.